1、制作豆腐时使用的凝固剂不同。普通豆腐用石膏做凝固剂，“内酯豆腐”使用一种叫“葡萄糖酸内酯”的东西作为凝固剂。
2、保质期不同。普通豆腐很难进行灭菌包装，内酯豆腐可以进行超高温灭菌，加入葡萄糖酸内酯之后，再装盒密封。这样得到的豆腐，保质期就远比另外两种豆腐要长。
3、口感不同。内酯豆腐的含水量更高，同样的豆浆可以做出更多的豆腐来，豆腐的质地明显要比卤水豆腐和石膏豆腐嫩滑与细腻。
4、钙镁含量不同。100克普通豆腐含蛋白质6.2克，脂肪2.5克，碳水化合物是2.4克，而钙和镁则分别是116毫克和36毫克。100克内酯豆腐含蛋白质6.2克，脂肪2.5克，碳水化合物是2.4克，而钙和镁则分别是116毫克和36毫克。